反映されません。
PCと接続して使用する場合は、通信用の測定条件があり、そちらが使用されます。

SpectraMagicNXの場合、メニューバーの“測定器”の“測定条件”がこれにあたります。

環境設定（コンディション1～6）は、メニューバーの“測定器”－“測定器設定”－“測定器設定”で、測定器への設定のみが可能です。
CM-S100wでは基準色毎に環境設定をファイルに保存し使い分ける方法が良く使用されます。